- Laboratoire d'aérologie
- Laboratoire d'Analyse, Topologie, Probabilités
- Laboratoire de Biologie
- Laboratoire de Biologie du Développement
- Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
- Laboratoire d'Ecologie Alpine
- Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
- Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
- Laboratoire de Génie Civil et d'Ingénierie Environnementale
- Laboratoire de Mecanique des Fluides et d'Acoustique
- Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand
- Laboratoire de Physique Nucléaire et de Hautes Énergies
- Laboratoire de recherche européen pour la polyarthrite rhumatoïde
- Laboratoire des Sciences de l'Image, de l'Informatique et de la Télédétection
- Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale
- Laboratoire d'Imagerie Moléculaire Expérimentale
- Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
- Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information
- Laboratoire d'optique et biosciences
- Laboratoire Statistique et Génome
- Laboratoire sur le langage, le cerveau et la cognition